아쿠아플라넷 제주 기프트샵은 아시아 최대 규모로 유명한 아쿠아플라넷 건물 지하 1층에 자리 잡은 기념품 판매점이다. 아쿠아리움의 해양생태계를 캐릭터로 만든 상품이 주를 이루며, 제주 여행 기념품도 함께 판매하고 있다. 아쿠아플라넷 제주 기프트샵은 입장권을 별도 구매하지 않더라도 방문이 가능하니 참고할 것.
매장에서 가장 인기가 많은 공간은 귀여운 펭귄 인형들이 만든 하트 모양의 포토존이다. 파란 펭귄들 사이에 분홍색 펭귄이 하트를 조성한다. 또, 일반적인 기념품 가게에서 보기 힘든 아쿠아플라넷 PB 제품이 가득하다. 펭귄, 돌고래, 상어 등의 각종 해양생물 캐릭터 인형부터 지갑, 가방과 같은 생활용품 그리고 공룡과 파충류 인형까지 판매하고 있다. 어른, 아이 할 것 없이 전 연령층에게 귀여운 인형의 인기가 높은 편.
또, 매장 한편에는 제주도가 표현된 문구류, 엽서, 의류 등의 상품이 진열되어 있다. 다만, 전문 기념품 판매점에 비하면 아주 다양한 품목이 구비되어 있진 않은 편이다. 일반적인 기념품이 아닌, 무언가 특별하고 개성 있는 상품을 찾을 때 방문할 만한 곳이다.